Hugo Müller wurde 1958 in Zürich geboren. Nach einer Hochbauzeichnerlehre von 1974 bis 1978 bei H.P. Zweidler + Partner AG in Wallisellen studierte er von 1978 bis 1981 an der ZHAW in Winterthur (vormals HTL) und diplomierte 1981 bei Prof. Max Kasper, Prof. Ulrich Baumgartner und Prof. Hansjörg Gügler.
Von 1981 bis 1986 arbeitete Hugo Müller im Architekturbüro Max Schönenberg und Partner AG in Zürich. In Zusammenarbeit mit Burckhardt Partner AG (Zürich) konnte er als Projektleiter für die Energiezentrale (Bausumme 65 Mio.) des neuen Rechenzentrums der SBG (Schweizerische Bankgesellschaft) in einem Team von 16 Fachleuten erste praktische Erfahrungen sammeln.
1987 gründete Hugo Müller an der Fröhlichstrasse in Zürich sein eigenes Architekturbüro.